科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業(JST-CREST)
マルチスケール・マルチフィジックス現象の統合シミュレーション領域
「ソフトマターの多階層/相互接続シミュレーション」プロジェクト
分子動力学拠点
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libmd3withg80src3.a (Version 100112a): source
libm2withmd3.a: source
- GNU General Public License (GPL)の下配布されているlibmd3withg80src3.a (バージョン100112a)は，MDGRAPE-3を用いて分子間相互作用を計算するMR3ライブラリと互換性のある，GPU向けのライブラリです．
- Makefile内のCUDA_INSTALL_PATHおよびCUDA_SDK_PATHをインストール先のNVIDIA toolkitおよびSDKのパスに置き換えて下さい．
- 32-bit環境またはバージョン2.2以前のCUDAを使用している場合は，さらにCUDA_LIBの/lib64を/libに書き換える必要があります．
- sample_md3（sample_md3.f）はCoulomb力，van der Waals力，Ewald法の実空間，波数空間の力を計算するサンプルプログラムです．
- libm2withmd3.aは，MR1およびm2関数を用いて書かれた従来のプログラムからMR3ライブラリを呼ぶためのライブラリです．MR1ライブラリを用いて書かれたプログラムを使用している場合は，libmd3withg80src3.aと同様にこのライブラリをリンクしてください．
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