Yasuoka Laboratory


2017/10/30(Mon) 10:00 - 11:30
Dr. Ian S. Osborne 氏
2017/06/20(Thu) 18:15 - 19:45
赤阪 清隆 氏,竹内 春久 氏



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更新日: 2020年10月29日
  • [3年生の皆さんへ]
    オンライン形式:Zoomにて行います.URLは研究室紹介のポスターをご参照ください.日時は,11/3 (火) 2限,11/11(水) 4限,11/16(月) 3限,です. (2020/10/29-)
  • 平川君(M1), 遠藤君(M2),岡田君(M2),小野君(M2),中村君(M2),湯原君(PD),Brumby君(PD)がThe 2nd Pacific Rim Thermal Engineering Conference(PRTEC2019)に参加して研究成果を発表しました. (2019/12/13-12/17)
  • 加藤君(B4),澤君(M2),岡田君(M2)が第33回分子シミュレーション討論会(名古屋)に参加して研究成果を発表しました.岡田君(M2)が優秀賞を受賞しました. (2019/12/9-12/11)
  • 三浦君(M1),荻野君(M2)が The 5th International Conference on Molecular Simulation (ICMS 2016)(Jeju, Korea)に参加して研究成果を発表しました. (2019/11/3-11/6)
  • 鈴木君 (M1)がYoung Researchers Forum on Quantum Information Science 2019(Taiwan)に参加して研究成果を発表しました. (2019/8/14 - 8/16)
  • Brumby君(PD), 長谷川君(M2)がClathrate Hydrates Fundamentals: Bridging Molecular Structures to Microscopic Properties and Behaviorに参加して研究成果を発表しました. (2019/6/25 - 6/29)
  • 長谷川君(M2)が15th International Conference on Properties and Phase Equilibria for Products and Process Designに参加して研究成果を発表しました. (2019/5/12 - 5/16)
  • プア君(B4),遠藤君(M1),岡田君(M1),荻野君(M1),小野君(M1),阿由葉君(M2),井上君(M2),野澤君(D3),湯原君(PD)が第32回分子シ>ミュレーション討論会(つくば)に参加して研究成果を発表しました. (2018/11/29-12/1)
  • 小野君 (M1)がFoundation of Molecular Modeling and Simulation 2018(Delevan, USA)に参加して研究成果を発表しました. (2018/9.10 - 9.14)
  • 阿由葉君(M2)がV International Conference on Colloid Chemistry and Physicochemical Mechanics(Moscow, Russia)に参加して研究成果を発表しました. (2018/9/10 - 9/14)


更新日: 2020年10月29日
  • キックオフミーティングを行いました.(2020年4月16日)
  • 忘年会を行いました.(2019年12月22日)
  • 秋合宿で金時山に登りました.(2019年11月8日~10日)
  • キックオフミーティングを行いました.(2019年9月27日)
  • OBOG会を行いました.(2019年9月7日)
  • 分子シミュレーションスクールに参加しました.(2019年9月2日-5日)
  • 春合宿を行いました.(2019年5月31日-2日)
  • キックオフミーティングを行いました.(2019年4月9日)
  • 多摩川土手で花見を行いました.(2019年3月30日)
  • 分子シミュレーション夏の学校に参加しました.(2018年9月12日)


更新日: 2020年04月30日

Hiraide, K., Hirayama, K., Endo, K., Muramatsu, M., "Application of deep learning to inverse design of phase separation structure in polymer alloy", Computational Material Science, 190, 110278-NULL 9(2020). DOI : 10.1016/j.commatsci.2021.110278

Endo K., Nakamura, T. Fuji, K.,N., Yamamoto, N., "Quantum self-learning Monte Carlo and quantum-inspired Fourier transform sampler", Physical Review Research, 2, 043442(2020). (12 pages) DOI : 10.1103/PhysRevResearch.2.043442

Hasegawa, T., Brumby, P. E., Yasuoka, K., Sum, A. K., "Mechanism for H2 diffusion in sII hydrates by molecular dynamics simulations", The Journal of Chemical Physics, 154, 054706(2020). (10 pages) DOI : 10.1063/5.0017505

Pua, K., Yuhara, D., Ayuba, S., Yasuoka, K., "Dataflow programming for the analysis of molecular dynamics with AViS, an analysis and visualization software application", PLOS One, 15, e0231714(2020). (13 pages) DOI : 10.1371/journal.pone.0231714

Anggayasti, W.L., Ogino, K., Yamamoto, E., Helmerhorst, E., Yasuoka, K., Mancera, R.L., "The acidic tail of HMGB1 regulates its secondary structure and conformational flexibility: A circular dichroism and molecular dynamics simulation study", Computational and Structural Biotechnology Journal, 18, 1160-1172(2020). (14 pages) DOI : 10.1016/j.csbj.2020.05.012

Yuhara, D., Yasuoka, K., Takeya, S. & Muromachi, S., "Anisotropy of dodecahedral water cages for guest gas occupancy in semiclathrate hydrates", Chemical Communications, 55, 10150-10153(2019). (4 pages) DOI : 10.1039/c9cc05009d

Brumby, P., Yuhuara, D., Hasegawa, T., Wu, D. T., Sum, A. K. & Yasuoka, K., "Cage occupancies, lattice constants, and guest chemical potentials for structure II hydrogen clathrate hydrate from Gibbs ensemble Monte Carlo simulations", Journal of Chemical Physics, in press. (15 pages) DOI : 10.1063/1.5084785

Endo, K., Yuhara, D., Tomobe K.,Yasuoka K., "Detection of molecular behavior that characterizes systems using a deep learning approach", Nanoscale, 11, 10064-10071(2019). (8 pages) DOI : 10.1039/C9NR00219G

Koishi, T., Yasuoka, K. & Zeng, X. C., "Method to Implement Interaction Surfaces with Virtual Companion Particles for Molecular Dynamics Simulations", Journal of Chemical and Engineering Data, in press. (8 pages) DOI : 10.1021/acs.jced.8b01230

Tomobe, K., Yamamoto, E. & Yasuoka, K., "Molecular Dynamic Simulations to Probe Water Permeation Pathways of GPCRs", Methods in Molecular Biology, 0, 21-30(2019). (10 pages) DOI : 10.1007/978-1-4939-9121-1__2

Nozawa, T., Brumby, P. E., Ayuba, S. & Yasuoka, K., "Ordering in clusters of uniaxial anisotropic particles during homogeneous nucleation and growth", Journal of Chemical Physics, in press. (13 pages) DOI : 10.1063/1.5064410

Winarto, W., Yamamoto, E. & Yasuoka, K., "Selectivity of Carbon Nanotubes under An Electric Field on Transferring Water - Alcohol Mixtures", Materials Science and Engineering, in press. (6 pages) DOI : 10.1088/1757-899X/494/1/012099

Winarto, W., Yamamoto, E. & Yasuoka, K., "Separation of water-alcohol mixtures using carbon nanotubes under an electric field", Physical Chemistry Chemical Physics, 21, 15431-15438(2019). (8 pages) DOI : 10.1063/1.5016609



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