Yasuoka Laboratory





セミナー情報

2017/10/30(Mon) 10:00 - 11:30
Dr. Ian S. Osborne 氏
2017/06/20(Thu) 18:15 - 19:45
赤阪 清隆 氏,竹内 春久 氏

学会情報



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ニュース

更新日: 2017年12月26日
  • 友部君(D3),山本特任助教,コイッチ特任講師(医学部),安井教授(医学部),佐藤教授との共同研究の結果がScience Advancesに掲載されました. その内容が本塾ホームページにてプレスリリースされました. (2017/12/25)
  • 阿由葉君(M1)が第31回分子シミュレーション討論会(金沢)にて学生優秀発表賞を受賞しました. (2017/11/29 - 12/01)
  • 九十九君(B4),阿由葉君(M1),長谷川君(M1),山光君(M2)が第31回分子シミュレーション討論会(金沢)に参加して研究成果を発表しました. (2017/11/29 - 12/01)
  • 今井君(M2),野澤君(D2)がTFEC9, The Ninth JSME-KSME Thermal and Fluids Engineering Conference(Okinawa, Japan)に参加して研究成果を発表しました. (2017/10/28 - 10/30)
  • 野澤君(D2),Brumby君(PD)がThermodynamics 2017 Edinburgh (Edinburgh, UK)に参加して研究成果を発表しました. (2017/09/05 - 09/08)
  • 野澤君(D2)がLiquids 2017, 10th Liquid Matter Conference(Ljubljana, Slovenia)に参加して研究成果を発表しました. (2017/07/17 - 07/21)
  • 阿由葉君(M1)がThe 20th International Conference on Nucleation and Atmospheric Aerosols(ICNAA2017)(Helsinki, Finland)に参加して研究成果を発表しました. (2017/06/25 - 06/30)
  • Brumby君(PD)が9th International Conference on Gas Hydrates(Denver, USA)に参加して研究成果を発表しました. (2017/06/25 - 06/30)
  • 長谷川君(M1),Brumby君(PD)がTelluride Science Research Center Workshop 2017 Clathrate Hydrates Fundamentals: Bridging Molecular Structures to Microscopic Properties and Behavior(Colorado, USA)に参加して研究成果を発表しました. (2017/06/20 - 06/24)
  • 友部君(D3)がNECデータサイエンス研究所(神奈川県川崎市)でGESLインターンシップを行い,その研究結果がPAKDD 2017に掲載されました. (2017/05/01)

研究室活動

更新日: 2017年10月05日
  • 分子シミュレーション夏の学校に参加しました.(2017年9月11日-13日)
  • 第11回分子シミュレーションスクールに参加しました.(2017年9月4日-7日)
  • 春合宿を行いました.(2017年5月26日-28日)
  • キックオフミーティングを行いました.(2017年4月11日)
  • 多摩川土手で花見を行いました.(2017年4月2日)
  • 秋合宿を行いました.(2016年11月4日-6日)
  • 第10回分子シミュレーションスクールに参加しました.(2016年10月18日-21日)
  • 分子シミュレーション夏の学校に参加しました.(2016年9月5日-7日)
  • OBOG会を行いました.(2016年9月3日)
  • 春合宿を行いました.(2016年5月21日-22日)

論文掲載情報(2017年~)

更新日: 2018年05月11日

Kaneko, T., Bali J., Akimoto T., Fransisco J. S., Yasuoka K.,and Zeng X. C., "Phase behaviors of deeply supercooled bilayer water unseen in bulk water", Proceedings of the National Academy of Sciences, 19, 4839-4844(2018). (6 pages) DOI : 10.1073/pnas.1802342115

Morita K., and Yasuoka K, "Density functional theory study of atomic and electronic properties of defects in reduced anatase TiO2 nanocrystals", AIP Advances, 8, 035119(2018). (14 pages) DOI : 10.1063/1.5021024

Suh, D., and Yasuoka, K.,, "Heterogeneous cavitation and crystallisation with an impurity by molecular dynamics", Molecular Simulation, 44, 530-533(2018). (4 pages) DOI : 10.1080/08927022.2017.1402308

Acocella, A., Hofinger, S., Haunshmid, E., Pop, C., S., Narumi, T., Yasuoka, K., Yasui, M., Zerbetto, F., "Structural determinants in the bulk heterojunction", Phys. Chem. Chem. Phys., 20, 5708-5720(2018). (13 pages) DOI : 10.1039/C7CP08435H

Tomobe, K., Yasuoka, K., "Detection of Anomalous Dynamics for a Signle Water Molecule", Journal of Chemical Theory and Computation, 14, 3(2018). (9 pages) DOI : 10.1021/acs.jctc.7b01104

Nozawa, T., Yasuoka, K., and Takahashi, K. Z., "Critical test of isotropic periodic sum techniques with group-based cut-off schemes", Scientific Reports, 8, 4185(2018). (9 pages) DOI : 10.1038/s41598-018-22514-3

Yuhara, D., Paul, E., B., David, T., W., Amadeu, K., S., Yasuoka, K., "Analysis of three-phase equilibrium conditions for methane hydrate by isometric-isothermal molecular dynamics simulations", The Journal of Chemical Physics, 148, 184501(2017). (9 pages) DOI : 10.1063/1.5016609

Tomobe, K., Yamamoto, E., Kojic, D., Sato, Y., Yasui, M., and Yasuoka, K., "Origin of the blueshift of water molecules at interfaces of hydrophilic cyclic compounds", Science Advances, 3, e1701400(2017). (7 pages) DOI : 10.1126/sciadv.1701400

Suh, D., and Yasuoka, K., "Heterogeneous cavitation and crystallisation with an impurity by molecular dynamics", Molec. Simul., in press. (4 pages) DOI : 10.1080/08927022.2017.1402308

Takahashi, K. Z., Nishimura, R., Yamato, N., Yasuoka, K., and Masubuchi, Y., "Onset of static and dynamic universality among molecular models of polymers", Scientific Reports, 7, 12379(2017). (7 pages) DOI : 10.1038/s41598-017-08501-0

Koishi, T., Yasuoka, K., and Zeng, X. C., "Molecular Dymamics Simulation of Water Nanodroplet Bounce Back from Flat and Nanopillared Surface", Langmuir, 33, 10184-10192(2017). DOI : 10.1021/acs.langmuir.7b02149

Takahashi, K. Z., Yamato, N., Yasuoka, K., and Masubuchi, Y., "Critical test of bead-spring model to resolve the scaling laws of polymer melts: a molecular dynamics study", Molec. Simul., 43, 1196-1201(2017). DOI : 10.1080/08927022.2017.1334883

Doi, H., Okuwaki, K., Mochizuki, Y., Ozawa, T., and Yasuoka, K., "Dissipative particle dynamics (DPD) simulations with fragment molecular orbital (FMO) based effective parameters for 1-Parmitoyl-2-oleoyl phosphatidyl choline (POPC) membrane", Chem. Phys. Lett., 684, 427-432(2017). DOI : 10.1016/j.cplett.2017.07.032

Winarto, Yamamoto, E., and Yasuoka, K., "Water Molecules in a Carbon Nanotube under an Applied Electric Field at Various Temperatures and Pressures", Water, 9, 473(2017). (14 pages) DOI : 10.3390/w9070473

Doi, H., and Yasuoka, K., "Replica exchange molecular simulation of Lennard-Jones particles in a two-dimensional confined system", AIP Advances, 7, 055018(2017). (9 pages) DOI : 10.1063/1.4984815

Tomobe, K., Yamamoto, E., Yasui, M., and Yasuoka, K., "Effects of temperature, concentration, and isomer on the hydration structure in monosaccharide solutions", Phys. Chem. Chem. Phys., 19, 15239-15246(2017). DOI : 10.1039/C7CP02392H

Shibuya, T., Yasuoka, K., Mirbt, S., and Sanyal, B., "Subsurface Polaron Concentration As a Factor in the Chemistry of Reduced TiO2 (110) Surfaces", J. Phys. Chem. C, 121, 11325-11334(2017). DOI : 10.1021/acs.jpcc.7b00935

Tomobe, K., Yamamoto, E., Kholmurodov, K., and Yasuoka, K., "Water permeation through the internal water pathway in activated GPCR rhodopsin", PLOS ONE, 12, e0176876(2017). DOI : 10.1371/journal.pone.0176876

Nomura, K., Kaneko, T., Bai, J., Francisco, J. S., Yasuoka, K., and Zeng, X. C., "Evidence of low-density and high-density liquid phases and isochore end point for water confined to carbon nanotube", PNAS, 114, 4066-4071(2017). DOI : 10.1073/pnas.1701609

Yamamoto, E., Akimoto, T., Kalli, A. C., Yasuoka, K., and Sansom, M. S. P., "Dynamic interactions between a membrane binding protein and lipids induce fluctuating diffusivity", Science Advances, 3, e1601871(2017). (6 pages) DOI : 10.1126/sciadv.1601871

Takahashi, K. Z., Nishimura, R., Yasuoka, K., and Masubuchi, Y., "Molecular Dynamics Simulations for Resolving Scaling Laws of Polythylene Melts", Polymers, 9, 24(2017). (12 pages) DOI : 10.3390/polym9010024


発表論文一覧


更新情報
2017/12/26
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